二战结束时，在德国劳工营和德军中幸存下来的立陶宛人有一半留在西方，有5000人逃往西方成了难民，另外有15万人移居波兰。

1944到1945年，被苏联处死的人数与逃亡的人数基本相等。斯大林将东普鲁士港口并入立陶宛后，归并过来的德国人后裔使立陶宛人口有所增加，他们也像立陶宛人一样敌视俄国人。

1946年春，立陶宛的“联合民主抵抗运动”招募了40000多人武装与苏联80000多人的秘密警察和正规军展开游击战。1947年，立陶宛反政府武装减少到25000人。1948年，苏联强迫推行农业集体化，反政府武装力量又恢复到30000人。游击活动在相当大的程度上减缓了立陶宛集体化的速度，只达到62%，但它也为此付出了高昂的代价：到1950年，反政府武装只剩下5000余人。

从1948年开始，中情局和英国秘密情报局支持波罗的海沿岸地区武装。威斯纳的政策协调署主要依赖西德格伦的情报机构开展活动。

“从一开始，格伦的组织就起着决定性作用。格伦手下的特工人员替政策协调署在难民营和定居德国的波罗的海难民中招募人员。代号为‘奥格’的小组负责筛选、甄别对象，并将他们推荐给美国人。”初级训练在德国完成，被选中的新手还要到美国学习像跳伞、收发报等特别课程。

波罗的海国家示意图

人力资源是非常丰富的。单是在西德，战后涌入的定居者就有4000多名爱沙尼亚人、11000名拉脱维亚人和5000名立陶宛人。中情局还在旅居美国的流亡者中直接招募特工。在波罗的海一带实施的秘密行动，主要从海路进行渗透。

中情局和英国秘密情报局认为这种方式比空降更可取：空降噪音大，容易引起飞行沿线上苏联人的注意；乘船登陆可以无声无息，有利于隐蔽。

英国有一支海上渗透力量，这就是由皇家海军组成的波罗的海渔业巡逻队，其表面工作是保护当地渔民不受苏联军舰的干扰，同时搜寻和排除战争期间遍布波罗的海的水雷。格伦的情报组织奉命组成秘密船队，使用英国人提供的渔业巡逻队的“E型”船只，并悬挂英国海军军旗，由中情局提供经费。这些人为美国效劳，按合同规定在最初筛选阶段付给他们德国马克，在美国受训的3个月中每周付125美元。其后，在“铁幕地区”内每待一天，报酬为100美元；如果他们的行动成功，还有1000美元的奖金。据称，参加秘密行动的人有半数左右保住了性命，但绝大部分行动都“遇到了这样或那样的麻烦”。

1951年以来，中情局与数家西方情报机构合作，派遣特工人员在拉脱维亚和爱沙尼亚的沿海地区登陆。然而，这里的反叛活动此时已近尾声。1950年2月，拉脱维亚游击队在最后一场战斗中损失殆尽，只剩下一些零零散散的残余武装；爱沙尼亚那一伙人则弹尽粮绝，虽然收到两箱武器和新派来的几名特工人员，但解决不了给养困难；立陶宛的叛乱组织于1952年被迫解散，有几支小队伍依靠中情局的援助继续与苏联人周旋，直到1960年还有关于逮捕反动武装分子的报道，到1964年还有关于击毙残余匪帮的报道。

1955年底，英国不再允许德国船只使用英国海军军旗，这样，船队就失去了掩护。于是在1956年，中情局与格伦的情报机构停止了秘密行动。

在波罗的海诸国的叛乱行动中，双方总计损失了将近10万人。