1947年5月，东北民主联军1纵换将，万毅改为政委，司令员由李天佑担任。

对于如此调整，总部有深度考虑的，更多情况证明，为接下来指挥大兵团攻坚作战做准备。如夏季攻势，展开三战四平攻坚战，以及秋季攻势、冬季攻势等一系列作战。

一般情况下，军事主官负责作战，政委负责作战以外所有工作，尤其是政治工作。可上级特批万毅不用处理政治工作，而是“学打仗”。

或许有人不可理解，万毅虽然在1944年加入八路军，至今3年时间，但过去是东北讲武堂毕业，长期担任军事主官，怎么还需要学打仗？

实际上，我军从土地革命到抗日战争时期，主要以游击战为主，然后是运动战等，这一点万毅并不熟悉。尽管加入革命队伍几年，也指挥过部队打过一些仗，可打攻坚战没有经验，打大兵团作战更没有经验。

在国军担任旅长时，最多指挥过2个团，也就是加入八路军后，指挥过5个团打顽军，已经觉得压力不小。抵达东北后，他的职务也越来越高，在1946年8月成立的1纵担任司令员，下辖3个师，每个师3个团，也就是说9个团归他指挥，带兵数量不断增加。

东北的战场形势，就是要大量消灭敌人有生力量，在担任1纵司令员时，指挥参加三下江南等作战，战斗也是可圈可点，可在之前一些战斗中打得有点不理想，一次歼灭战打成消耗战。

东北部队纵队司令员中，只有他的资历浅，其他纵队司令、师长都是资历很深，打仗很多的将领，熟悉部队各项作战等。

在接下来的大作战中，大规模城市攻坚战是可预见的，李天佑过去就善意打攻坚战，如今把他放到位置上，再合适不过。原本万毅被调二线，他坚持留在一线。根据他的要求，上级改任他为政委。

他作为军事干部，转头干政治工作，实际上对他来说也是为难。从来没有干过，因此具体工作都是由副政委负责。上级也因此锻炼一下他在军事作战、指挥方面的能力。

部队展开夏季攻势，三打四平；秋季攻势，再战强敌；冬季攻势，四战四平，最终歼灭四平守敌1.8万 。

战斗结束后，他在新成立的5纵担任司令，并参加辽沈战役、平津战役等。